More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0323 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
488 aa  961    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  58.07 
 
 
489 aa  520  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1222  major facilitator transporter  44.37 
 
 
466 aa  330  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
461 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0993  major facilitator transporter  30.39 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000427964  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1772  major facilitator transporter  28.64 
 
 
489 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0605301  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.04 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.64 
 
 
457 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  27.96 
 
 
475 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
448 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
458 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
459 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
463 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  26.64 
 
 
459 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.47 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  25.79 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  25.82 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  25.82 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.83 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  26.17 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.01 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  31.48 
 
 
449 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  25.59 
 
 
459 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
459 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
461 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.27 
 
 
460 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.85 
 
 
459 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0335  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
476 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.05 
 
 
464 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.79 
 
 
487 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.79 
 
 
487 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.7 
 
 
485 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.26 
 
 
485 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  29.71 
 
 
482 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.26 
 
 
438 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  27.83 
 
 
448 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.12 
 
 
474 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.54 
 
 
455 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
450 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.36 
 
 
485 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.76 
 
 
474 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
452 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  25.98 
 
 
452 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
472 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.18 
 
 
474 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24.76 
 
 
474 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  27.92 
 
 
483 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.33 
 
 
472 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
447 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.95 
 
 
474 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  25.84 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  24.31 
 
 
451 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  25.74 
 
 
473 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  27.62 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  25.88 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.13 
 
 
479 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  25.88 
 
 
452 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  25.88 
 
 
452 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  28.8 
 
 
504 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.13 
 
 
479 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  33.33 
 
 
485 aa  96.7  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.85 
 
 
476 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.3 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  25.88 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
495 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
452 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  24.47 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
466 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  25.61 
 
 
514 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
452 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  25.92 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  26.46 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.78 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  24.33 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  26.18 
 
 
416 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
478 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  25.48 
 
 
437 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  25.28 
 
 
473 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.67 
 
 
452 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  28.9 
 
 
494 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.06 
 
 
446 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.81 
 
 
399 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  25.72 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.17 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  25.72 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.17 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>