More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0245 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0245  putative permease  100 
 
 
449 aa  885    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  52.82 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  59.28 
 
 
445 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  55.94 
 
 
477 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  55.66 
 
 
435 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  52.65 
 
 
485 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  54.87 
 
 
447 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  48.31 
 
 
447 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
451 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  44.6 
 
 
399 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  44.12 
 
 
399 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  43.88 
 
 
399 aa  329  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  46.12 
 
 
438 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  43.65 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 
398 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  42.45 
 
 
399 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
404 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  35.48 
 
 
455 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  36.91 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.11 
 
 
455 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  36.91 
 
 
474 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
472 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  36.69 
 
 
474 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  36.91 
 
 
474 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
451 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.95 
 
 
472 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  35.89 
 
 
457 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  36.18 
 
 
474 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  36.32 
 
 
473 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  34.51 
 
 
459 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  35.89 
 
 
476 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.34 
 
 
467 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
478 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  36.18 
 
 
478 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
478 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
478 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
478 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
478 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  35.96 
 
 
478 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  36.73 
 
 
459 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  36.17 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
456 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  58.59 
 
 
539 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  39.45 
 
 
436 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  39.95 
 
 
436 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  37.5 
 
 
464 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  39.75 
 
 
436 aa  236  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  39.75 
 
 
436 aa  236  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  36.21 
 
 
456 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  34.99 
 
 
514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  37.18 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  38.58 
 
 
381 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  35.14 
 
 
509 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  35.46 
 
 
526 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  36.98 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  35.51 
 
 
415 aa  220  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
465 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
470 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  35.6 
 
 
437 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  35.84 
 
 
438 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  39.37 
 
 
372 aa  216  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  35.57 
 
 
437 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  38.58 
 
 
382 aa  210  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  36.04 
 
 
422 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.07 
 
 
468 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
380 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  35.79 
 
 
422 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  32.23 
 
 
422 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.41 
 
 
468 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  32.9 
 
 
424 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.44 
 
 
398 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
473 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
459 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.1 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  30.84 
 
 
463 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
467 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  33.85 
 
 
479 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  30.74 
 
 
460 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.56 
 
 
434 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.29 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
459 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
454 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
462 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  29.79 
 
 
461 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
446 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.45 
 
 
467 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.22 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.25 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.7 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.7 
 
 
462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>