More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0856 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 483 aa  948    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  62.85 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  58.39 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 491 aa  498  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  55.37 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  55.86 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  57.41 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  54.22 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  53.91 
 
 		 495 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  56.31 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  54.37 
 
 		 480 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  54.64 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  54.11 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  53.6 
 
 		 597 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  53.77 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  53.21 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  53.83 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  53.39 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  53.39 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  53.91 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  53.6 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  49.58 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 465 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.04 
 
 		 455 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.9 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.51 
 
 		 460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.72 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 470 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.18 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 438 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  28.24 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  28.36 
 
 		 467 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.91 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.7 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  28 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.65 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  28.07 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  28.07 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>