More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3612 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  88.84 
 
 		 481 aa  818    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  78.06 
 
 		 504 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  80.97 
 
 		 493 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  80.38 
 
 		 493 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  79.75 
 
 		 494 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  100 
 
 		 476 aa  929    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  79.75 
 
 		 495 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  69.81 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  67.59 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  67.65 
 
 		 488 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  68.51 
 
 		 483 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  68.08 
 
 		 489 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  67.87 
 
 		 483 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 		 491 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  67.72 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  66.88 
 
 		 491 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  64.98 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  64.27 
 
 		 490 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  67.95 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  64.68 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  55.86 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  56.7 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  55.91 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  55.43 
 
 		 457 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.32 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  51.91 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  49.58 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  49.9 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.47 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 447 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.3 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.88 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.23 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.66 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.96 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  36.8 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  31.92 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.59 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 399 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.07 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 399 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.72 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.72 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.93 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.73 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>