More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1785 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  991    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  61.59 
 
 		 479 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  56.19 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  55.88 
 
 		 483 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.09 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  52.12 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  51.62 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  51.38 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  49.68 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  48.65 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  49.58 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  50.21 
 
 		 474 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 490 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  49.79 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  49.27 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 497 aa  339  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 481 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  28.18 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 451 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 465 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.71 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.33 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.87 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.46 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.7 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.56 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  29.25 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 479 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.69 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.9 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.78 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 470 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  26.49 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.64 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.05 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  26.47 
 
 		 477 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>