More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3530 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  68.07 
 
 		 480 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  71.04 
 
 		 483 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  70.69 
 
 		 483 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  86.68 
 
 		 489 aa  789    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  95.72 
 
 		 491 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 491 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  67.36 
 
 		 481 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  71.83 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  67.29 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  65.36 
 
 		 504 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  67.86 
 
 		 493 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  64.96 
 
 		 494 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  67.52 
 
 		 476 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  64.75 
 
 		 495 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  67.57 
 
 		 484 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  65.18 
 
 		 490 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  64.49 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  65.04 
 
 		 492 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  63.28 
 
 		 492 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  63.49 
 
 		 492 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  63.98 
 
 		 472 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  58.64 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.14 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.58 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  52.95 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.42 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  48.88 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 447 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.64 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.08 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.46 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.71 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.55 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.7 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.56 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.1 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.31 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.65 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.59 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  34.93 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.95 
 
 		 476 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  27.48 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 467 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  34.3 
 
 		 471 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>