More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9266 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  100 
 
 		 479 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  62.42 
 
 		 483 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  61.59 
 
 		 493 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  57.83 
 
 		 494 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  50.73 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  51.91 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.62 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  50.32 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 		 597 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  50 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  49.06 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  50.83 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  49.05 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  49.57 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  49.28 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 497 aa  359  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 446 aa  203  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 479 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.66 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.57 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.89 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.18 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.47 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.33 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  28.36 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.35 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.87 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28.96 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  27.9 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.85 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 448 aa  120  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  28.78 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>