More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4525 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  77.57 
 
 		 481 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  83 
 
 		 495 aa  767    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  81.21 
 
 		 493 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  960    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  80.17 
 
 		 504 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  82.29 
 
 		 494 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  80.38 
 
 		 476 aa  729    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  69.38 
 
 		 480 aa  624  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  68.97 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  67.86 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  69.57 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  67.65 
 
 		 491 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  68.08 
 
 		 488 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  66.26 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  67.96 
 
 		 597 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  67.57 
 
 		 484 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  64.56 
 
 		 490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  64.26 
 
 		 492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  64.47 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  66.17 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  65.12 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  59.83 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  54.91 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  56.67 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  56.6 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  55.11 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  54.37 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  48.73 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.27 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  48.33 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 481 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.09 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.45 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.03 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.91 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  27.83 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.22 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  33.33 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  37.67 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.63 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.66 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 464 aa  103  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.45 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.43 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.08 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>