More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4845 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  886    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  79.03 
 
 		 514 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  72.97 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  66.11 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  55.43 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  54.45 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  54.87 
 
 		 480 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  56.7 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  54.37 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  55.6 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  53.64 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 483 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  51.2 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  51.96 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  53.42 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  49.79 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  51.87 
 
 		 483 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  53.11 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  50.43 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  53.76 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.33 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 		 492 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  53.78 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  49.01 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 481 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 485 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.44 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.68 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  38.16 
 
 		 477 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.78 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 479 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 399 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.18 
 
 		 399 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.67 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  32.65 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.37 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  32.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  32.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  32.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  32.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  29.61 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.67 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.78 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>