More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4276 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  83.54 
 
 		 490 aa  781    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  99.8 
 
 		 492 aa  956    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  93.9 
 
 		 492 aa  860    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  100 
 
 		 492 aa  957    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  64.72 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  65.47 
 
 		 481 aa  591  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  64.57 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 488 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  66.25 
 
 		 484 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  65.68 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  61.96 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  64.47 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  63.79 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  63.49 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  63.5 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  63.28 
 
 		 491 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  62.5 
 
 		 483 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 489 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  62.89 
 
 		 597 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  60.43 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.39 
 
 		 483 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  56.17 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.98 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  48.11 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.27 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  51.32 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  52.14 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  47.28 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.23 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.89 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.87 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.49 
 
 		 476 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.55 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 474 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.51 
 
 		 468 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.56 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.99 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 470 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.68 
 
 		 478 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.65 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.17 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.76 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 445 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.9 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  25 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.23 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.62 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.54 
 
 		 449 aa  110  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.64 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.3 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>