More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2549 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 495 aa  993    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  58.56 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  50.83 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  49.48 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 597 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 479 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 489 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  50.3 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  46.23 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 490 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  48.75 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  48.47 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 492 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  49.48 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  49.79 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 481 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 465 aa  143  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 456 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.35 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.48 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.89 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.94 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.84 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.2 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.34 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.75 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.07 
 
 		 468 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.21 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.12 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.95 
 
 		 462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 474 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.06 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.71 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.88 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.77 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 450 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.32 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.88 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>