More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2500 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  100 
 
 		 483 aa  947    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  94.19 
 
 		 483 aa  849    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  71.04 
 
 		 491 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  71.13 
 
 		 489 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  70.62 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  68.35 
 
 		 504 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  68.71 
 
 		 480 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  68.51 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  68.97 
 
 		 493 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  66.25 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  68.71 
 
 		 597 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  66.46 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  65.96 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  66.74 
 
 		 493 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  64.21 
 
 		 488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  63.88 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 492 aa  561  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  62.71 
 
 		 492 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  63.33 
 
 		 492 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  61.88 
 
 		 490 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  64.53 
 
 		 472 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  55.37 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  56.62 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 491 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  55.51 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  56.53 
 
 		 514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  53.52 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  50.96 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.42 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 481 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 		 445 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.11 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 435 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.81 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 479 aa  124  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.41 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.25 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.06 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.16 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.32 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.29 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.7 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.59 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.14 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27 
 
 		 443 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 399 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.09 
 
 		 461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  29.63 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>