More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0050 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  100 
 
 		 484 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  54.56 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  52.03 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 		 597 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  52.14 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  53.29 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  51.28 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  55.39 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 491 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  53.52 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  52.56 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 479 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  51.98 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  52.93 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  53.67 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  51.78 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  51.46 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  49.89 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.18 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  53.76 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.42 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.5 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.85 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.24 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 463 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.77 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.34 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  34.44 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 473 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  29.32 
 
 		 468 aa  123  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.57 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.65 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.23 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.94 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  28.6 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.3 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.87 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>