More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2715 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  100 
 
 		 491 aa  966    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 479 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  52.67 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  54.43 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  50.83 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 494 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  52.07 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  53.3 
 
 		 597 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  52.6 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  51.8 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.83 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 		 495 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  54.32 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  51.32 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  51.03 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  50.73 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  51.58 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  50.43 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 481 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.88 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 485 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.69 
 
 		 462 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.13 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.69 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  38.01 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.04 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.93 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 459 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.92 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.87 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.46 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 470 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.08 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  27.81 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.76 
 
 		 476 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 480 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 487 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 482 aa  113  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.75 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>