More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4498 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  76.11 
 
 		 478 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  69.11 
 
 		 467 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  68.47 
 
 		 467 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  68.68 
 
 		 479 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 467 aa  930    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 467 aa  930    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  66.44 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  66.29 
 
 		 468 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  66.21 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  66.29 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  66.29 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  65.85 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  66.37 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  38.91 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 485 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 461 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  36.34 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 474 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 474 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 474 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.29 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.93 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.31 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.44 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.7 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.14 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 478 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 478 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 456 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.13 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.39 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 399 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 399 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 399 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 447 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.54 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.54 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 514 aa  156  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.59 
 
 		 462 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 		 468 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.57 
 
 		 450 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>