More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3624 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 597 aa  1184    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  68.99 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  71.83 
 
 		 491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  70.34 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  67.09 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  67.31 
 
 		 495 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  67.96 
 
 		 494 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  67.59 
 
 		 476 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  70.75 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  66.24 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  68.71 
 
 		 483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  69.89 
 
 		 483 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  67.96 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  67.74 
 
 		 488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  67.1 
 
 		 484 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  65.81 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  62.88 
 
 		 490 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  62.89 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  62.89 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  63.18 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  62.96 
 
 		 472 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  59.28 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  58.17 
 
 		 483 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.6 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  57.94 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  59.19 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 495 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 484 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  51.38 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  52.03 
 
 		 483 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  49.46 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.96 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.96 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.79 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.15 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 447 aa  131  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 480 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 423 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.59 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 487 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  34.84 
 
 		 449 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.69 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  37.17 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 474 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 466 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.7 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.03 
 
 		 450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  28.67 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  29.56 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  28.54 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  28.54 
 
 		 468 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 473 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  28.54 
 
 		 468 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>