More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6930 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
460 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  78.31 
 
 
457 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  60.09 
 
 
453 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  58.43 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  58.43 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  58.43 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  53.13 
 
 
445 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  52.9 
 
 
445 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  52.9 
 
 
445 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  52.9 
 
 
445 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  52.9 
 
 
445 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  52.9 
 
 
445 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  52.9 
 
 
469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  52.9 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  40.65 
 
 
446 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  39.72 
 
 
439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  38.88 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  37.18 
 
 
464 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  36.66 
 
 
445 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  37.47 
 
 
443 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  36.19 
 
 
438 aa  289  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  35.8 
 
 
452 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  37.56 
 
 
442 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  36.76 
 
 
458 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  35.19 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  35.19 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  35.19 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  35.19 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  35.19 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  35.19 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  34.93 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  34.93 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  34.95 
 
 
443 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  34.93 
 
 
468 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  34.7 
 
 
468 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  34.7 
 
 
468 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  34.49 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  36.18 
 
 
442 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  37.5 
 
 
442 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  33.33 
 
 
457 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  32.62 
 
 
434 aa  216  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  29.38 
 
 
447 aa  209  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  32.5 
 
 
468 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.35 
 
 
476 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
456 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.64 
 
 
485 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.42 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.23 
 
 
447 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.67 
 
 
427 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.35 
 
 
472 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.59 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.65 
 
 
457 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
465 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.38 
 
 
465 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
465 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
451 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
473 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.07 
 
 
492 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.03 
 
 
474 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
446 aa  137  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.03 
 
 
474 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
451 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.7 
 
 
473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.86 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.81 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
461 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
478 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
459 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.55 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.43 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.43 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.39 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.29 
 
 
455 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.71 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.71 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.71 
 
 
475 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.14 
 
 
476 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.87 
 
 
474 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  27.62 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  27.4 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.57 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.02 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  29.67 
 
 
437 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.12 
 
 
463 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
459 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>