More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2828 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  81.38 
 
 
460 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  100 
 
 
457 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  61.61 
 
 
453 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  60.74 
 
 
452 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  60.97 
 
 
452 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  60.74 
 
 
452 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  55.56 
 
 
469 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  56.41 
 
 
445 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  56.41 
 
 
445 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  56.41 
 
 
445 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  56.41 
 
 
445 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  56.41 
 
 
445 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  56.41 
 
 
445 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  56.18 
 
 
445 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  41.34 
 
 
446 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  39.63 
 
 
445 aa  316  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  39.62 
 
 
439 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  40.19 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  38.46 
 
 
452 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  37.59 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  39.54 
 
 
443 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  37.16 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  37.16 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  37.35 
 
 
443 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  36.94 
 
 
468 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  36.94 
 
 
468 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  37.56 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  37.35 
 
 
443 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
443 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  37.35 
 
 
443 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  37.35 
 
 
443 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  37.35 
 
 
443 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  36.94 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  37.35 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  37.33 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  37.12 
 
 
443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  35.96 
 
 
480 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  37.33 
 
 
442 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  37.33 
 
 
442 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  36.95 
 
 
442 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  34.63 
 
 
457 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  34.23 
 
 
468 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  32.08 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  32.62 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.14 
 
 
476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
470 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.08 
 
 
447 aa  153  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
423 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.03 
 
 
463 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  29.55 
 
 
475 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
451 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  29.55 
 
 
475 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.06 
 
 
460 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
456 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.45 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.23 
 
 
427 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.01 
 
 
465 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  33.17 
 
 
464 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
465 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28 
 
 
472 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  29.6 
 
 
475 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.49 
 
 
492 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.21 
 
 
457 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  31.66 
 
 
460 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.78 
 
 
468 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.07 
 
 
450 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  31.78 
 
 
469 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.46 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
472 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.6 
 
 
474 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.64 
 
 
499 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.75 
 
 
471 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
454 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.15 
 
 
474 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
461 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.38 
 
 
473 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.38 
 
 
474 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
446 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.69 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.3 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.86 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
473 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.3 
 
 
462 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  26.91 
 
 
463 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  29.35 
 
 
489 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.33 
 
 
474 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  29.35 
 
 
489 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 
489 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.4 
 
 
476 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  29.26 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  29.26 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>