More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4810 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  78.68 
 
 		 457 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  77.66 
 
 		 483 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  100 
 
 		 514 aa  1012    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  69.45 
 
 		 501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  59.19 
 
 		 597 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  54.99 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  56.53 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  54.32 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.91 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  55.89 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  53.2 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  53.6 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  55.03 
 
 		 490 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  55.08 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  53.54 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  54.58 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  55.63 
 
 		 484 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  54.06 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  54.27 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.96 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  49.47 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  53.72 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  54.18 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  49.57 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 456 aa  158  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  28.36 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.29 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.04 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.97 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.41 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  30.67 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.9 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 482 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.11 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 479 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 459 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  36.51 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.69 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.57 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.81 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  32.56 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  32.56 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>