More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1576 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 483 aa  940    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  77.66 
 
 		 514 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  72.89 
 
 		 457 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  67.33 
 
 		 501 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  56.48 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  58.17 
 
 		 597 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  55.91 
 
 		 476 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  54.11 
 
 		 483 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  53.29 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  56.6 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  54.89 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  55.41 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  56.24 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  55.44 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  56.08 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  56.29 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  54.35 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  56.17 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  55.08 
 
 		 472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  54.55 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  56 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  55.39 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  52.38 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  54.45 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 		 492 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  53.72 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  53.29 
 
 		 492 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 456 aa  167  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 485 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 487 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 		 450 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 438 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 459 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 479 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.18 
 
 		 460 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.15 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.04 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 465 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.34 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.55 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.12 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.81 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 479 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.5 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.88 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.75 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.78 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  36.36 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.88 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.48 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.41 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 488 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.62 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>