More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3249 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
497 aa  971    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 
597 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  59.62 
 
 
484 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  54.93 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 
491 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  54.91 
 
 
474 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  53.32 
 
 
504 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  54.6 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  54.04 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  53.07 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  55.22 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  53.81 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  54.47 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  53.94 
 
 
493 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  54.41 
 
 
501 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 
484 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  53.72 
 
 
514 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  53.85 
 
 
483 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  54.27 
 
 
493 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 
472 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  54.04 
 
 
488 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  54.68 
 
 
483 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  49.79 
 
 
483 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  52.34 
 
 
490 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 
492 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  52.14 
 
 
492 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 
495 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  51.48 
 
 
492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  50 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  53.78 
 
 
457 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  49.79 
 
 
483 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  48.73 
 
 
493 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  47.46 
 
 
479 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  47.57 
 
 
494 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
446 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.35 
 
 
481 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.47 
 
 
465 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.71 
 
 
479 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.97 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.22 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
435 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.9 
 
 
438 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.79 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.15 
 
 
463 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.75 
 
 
447 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
461 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.46 
 
 
459 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.58 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.78 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.78 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.4 
 
 
479 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
479 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
459 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.05 
 
 
459 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
488 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
470 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.41 
 
 
477 aa  116  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  28.99 
 
 
480 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  27.73 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  27.73 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  27.73 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  28.78 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  28.78 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.62 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.05 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.93 
 
 
485 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.05 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  27.87 
 
 
475 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.26 
 
 
485 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.75 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.48 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  34.84 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  31.18 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.07 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
399 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
456 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.09 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  27.45 
 
 
475 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.33 
 
 
487 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
423 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.13 
 
 
399 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.33 
 
 
487 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  26.88 
 
 
472 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.86 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  27.53 
 
 
472 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  25.68 
 
 
484 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.17 
 
 
485 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>