More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2550 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  100 
 
 
481 aa  956    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  37.53 
 
 
465 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
446 aa  246  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
483 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  36.08 
 
 
489 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  35.24 
 
 
476 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 
484 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  33.18 
 
 
481 aa  204  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  34.1 
 
 
491 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
491 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  32.42 
 
 
494 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  33.26 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  32.94 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  34.01 
 
 
484 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  32.7 
 
 
488 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
492 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  33.68 
 
 
483 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  32.49 
 
 
490 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  32.84 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  33.64 
 
 
474 aa  196  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
495 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
597 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  32.03 
 
 
491 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  32.48 
 
 
504 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  32.08 
 
 
483 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  31.86 
 
 
493 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  29.63 
 
 
479 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
451 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  34.69 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  30.54 
 
 
483 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
495 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  29.41 
 
 
494 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
497 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
472 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  32.23 
 
 
493 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.65 
 
 
455 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  31.13 
 
 
493 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.17 
 
 
447 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.65 
 
 
472 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  30.5 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.57 
 
 
459 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.42 
 
 
474 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.7 
 
 
455 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.18 
 
 
474 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.85 
 
 
473 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  33.62 
 
 
457 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.18 
 
 
474 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.19 
 
 
474 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.85 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.17 
 
 
467 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.19 
 
 
476 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.9 
 
 
477 aa  150  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.25 
 
 
438 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.65 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.65 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.65 
 
 
478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
456 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.28 
 
 
456 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.25 
 
 
485 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
462 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.76 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.19 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.6 
 
 
485 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25 
 
 
468 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
470 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
451 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
450 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
451 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
467 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
467 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  31.2 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.7 
 
 
485 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.93 
 
 
485 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  27.58 
 
 
436 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.35 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.13 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.13 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.93 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.02 
 
 
478 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
465 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.86 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.31 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  28.24 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>