More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0195 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  872    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  35.74 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  35.7 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 473 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 490 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 480 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 491 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  36.2 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 483 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.05 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 483 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.77 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  32.54 
 
 		 483 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  34.46 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.13 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 493 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 492 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 472 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 492 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  33.49 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.25 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.67 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  35.81 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  31.52 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.75 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.18 
 
 		 526 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  33.26 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 459 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  32 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  33.19 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 399 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 462 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.75 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.98 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  32.24 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.07 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>