More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3242 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
539 aa  1016    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  53.22 
 
 
485 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 
451 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  72.12 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  71.88 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  73.39 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  65.24 
 
 
473 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  66.96 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  58.59 
 
 
449 aa  259  7e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
465 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.01 
 
 
472 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  51.38 
 
 
447 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  50 
 
 
438 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  52.48 
 
 
398 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  191  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  191  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  47.29 
 
 
399 aa  190  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 
404 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
399 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 
398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  45.85 
 
 
399 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
472 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  41.23 
 
 
476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  46.39 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  42.33 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  42.33 
 
 
474 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  42.33 
 
 
473 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  42.33 
 
 
474 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
456 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  41.12 
 
 
474 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
451 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  43.46 
 
 
478 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
478 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  39.07 
 
 
457 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
478 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
478 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
478 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
478 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.87 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  42.99 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  41.86 
 
 
473 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  34.5 
 
 
455 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  46.3 
 
 
415 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
446 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
451 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  40.27 
 
 
467 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  44 
 
 
382 aa  144  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  39.55 
 
 
509 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  48.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  40.74 
 
 
456 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.48 
 
 
459 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  47.22 
 
 
381 aa  140  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  39.36 
 
 
469 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  47.2 
 
 
436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.5 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  37.76 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  47.2 
 
 
436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  40 
 
 
514 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  40.57 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
380 aa  136  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.93 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  40.78 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  40.55 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  45.03 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
466 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  39.41 
 
 
388 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  37.31 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  39.64 
 
 
468 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  46.71 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  36.92 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  39.21 
 
 
462 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  42.78 
 
 
436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  45.97 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  39.21 
 
 
462 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  24.32 
 
 
648 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  35.84 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  40.43 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.7 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.42 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
597 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  37.96 
 
 
472 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  37.96 
 
 
472 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  37.96 
 
 
472 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  38.13 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  36.73 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  38.43 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  46.31 
 
 
437 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  34.68 
 
 
464 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>