More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7070 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  71.49 
 
 
468 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  71.52 
 
 
466 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  71.52 
 
 
466 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  71.49 
 
 
474 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  68.47 
 
 
467 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  71.59 
 
 
468 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  71.49 
 
 
468 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  71.49 
 
 
468 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  71.43 
 
 
478 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  71.56 
 
 
468 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
467 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  70.24 
 
 
466 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  68.47 
 
 
467 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  71.49 
 
 
474 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  73.76 
 
 
468 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  98.29 
 
 
479 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  71.52 
 
 
466 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  82.87 
 
 
467 aa  788    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  71.31 
 
 
466 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  71.31 
 
 
466 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  70.88 
 
 
466 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  40.66 
 
 
480 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  40.66 
 
 
480 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  40.44 
 
 
480 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  39.32 
 
 
480 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  39.32 
 
 
480 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
459 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  38.5 
 
 
463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
461 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  37.92 
 
 
460 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  38.2 
 
 
471 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  39.09 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  39.42 
 
 
455 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
485 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
451 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
451 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.06 
 
 
447 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
451 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.48 
 
 
455 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.72 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.52 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.22 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.52 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.09 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.86 
 
 
462 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
459 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.22 
 
 
473 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.1 
 
 
457 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.02 
 
 
468 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.11 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.06 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.04 
 
 
459 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.74 
 
 
478 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.32 
 
 
470 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
470 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.04 
 
 
476 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.36 
 
 
472 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.52 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.52 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.52 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.52 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.29 
 
 
478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.52 
 
 
478 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.79 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
472 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.39 
 
 
467 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
456 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.51 
 
 
468 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
446 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.11 
 
 
399 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
466 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.11 
 
 
461 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.23 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.52 
 
 
462 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.14 
 
 
399 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.44 
 
 
399 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
399 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
399 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
399 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
399 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.33 
 
 
399 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.91 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
465 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.59 
 
 
509 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
404 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
447 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
398 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.37 
 
 
449 aa  150  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.74 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  29.36 
 
 
438 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  26.97 
 
 
459 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  31.57 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.13 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>