More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0313 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
489 aa  967    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  58.07 
 
 
488 aa  546  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1222  major facilitator transporter  50.32 
 
 
466 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1772  major facilitator transporter  30.75 
 
 
489 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0605301  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0993  major facilitator transporter  33.07 
 
 
497 aa  156  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000427964  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
461 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.29 
 
 
485 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  29.89 
 
 
475 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.76 
 
 
485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.57 
 
 
487 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.65 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
458 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.35 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  26.87 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.35 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.35 
 
 
457 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.02 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  27.01 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
476 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.22 
 
 
455 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.95 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.71 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.17 
 
 
447 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.26 
 
 
472 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.9 
 
 
473 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
472 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.95 
 
 
474 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  27.06 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.36 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.36 
 
 
478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.36 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.36 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.74 
 
 
478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
448 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  33.22 
 
 
449 aa  120  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  30.66 
 
 
504 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.12 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.57 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.76 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  39.37 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
473 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  28.21 
 
 
491 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.7 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.07 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
495 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.44 
 
 
476 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.7 
 
 
450 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
597 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  28.79 
 
 
494 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
398 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
483 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  28.16 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.86 
 
 
476 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
491 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.61 
 
 
479 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  28.34 
 
 
480 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
483 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.92 
 
 
474 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  28.74 
 
 
476 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  27.47 
 
 
448 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  27.62 
 
 
490 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  25.87 
 
 
479 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  27.4 
 
 
494 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  29.22 
 
 
493 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.01 
 
 
463 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  26.61 
 
 
471 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  28.33 
 
 
481 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  25.65 
 
 
479 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  27.66 
 
 
483 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
492 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  26.94 
 
 
492 aa  106  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.23 
 
 
463 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  31.67 
 
 
501 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.93 
 
 
473 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.6 
 
 
399 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  26.18 
 
 
459 aa  106  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.06 
 
 
468 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
492 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  29.67 
 
 
493 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0460  hypothetical protein  33.94 
 
 
219 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
459 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.2 
 
 
399 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  28.44 
 
 
489 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  29.22 
 
 
491 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
472 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  25.68 
 
 
514 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
466 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.2 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.2 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>