More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0694 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  100 
 
 
459 aa  911    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  65.34 
 
 
469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  53.56 
 
 
477 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  50.22 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  47.65 
 
 
443 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  47.65 
 
 
441 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  45.45 
 
 
442 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  45.23 
 
 
442 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  45.09 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  43.83 
 
 
471 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  42.54 
 
 
458 aa  319  6e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  35.86 
 
 
555 aa  265  8.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  32.79 
 
 
555 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  34.03 
 
 
476 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  33.77 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  33.48 
 
 
427 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  31.85 
 
 
460 aa  203  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  33.63 
 
 
456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
465 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
465 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  33.63 
 
 
458 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  33.63 
 
 
458 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  33.4 
 
 
471 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  31.61 
 
 
566 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  32.89 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.98 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  29.81 
 
 
623 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  29.87 
 
 
451 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  30.22 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  30.82 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.73 
 
 
447 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  29.06 
 
 
499 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  28.44 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29.93 
 
 
457 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.7 
 
 
438 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.17 
 
 
480 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.5 
 
 
452 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  29.3 
 
 
477 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
398 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
443 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  28.33 
 
 
530 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
443 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.87 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.87 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.87 
 
 
443 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  27.74 
 
 
663 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.03 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  28.07 
 
 
515 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
508 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.25 
 
 
463 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.96 
 
 
459 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.73 
 
 
468 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.73 
 
 
468 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.51 
 
 
468 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.51 
 
 
468 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.51 
 
 
468 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  27.41 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  27.38 
 
 
458 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
399 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  28.44 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
398 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.61 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.11 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  28.57 
 
 
441 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.45 
 
 
446 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.72 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
451 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00217  phosphate permease (AFU_orthologue; AFUA_5G01320)  29.34 
 
 
443 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00909973  normal  0.554157 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.96 
 
 
471 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.67 
 
 
455 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  27.15 
 
 
457 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  28.63 
 
 
493 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.03 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.58 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
404 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  27.95 
 
 
729 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.29 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.53 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  26.55 
 
 
466 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.89 
 
 
457 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  29.25 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.92 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  28.79 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  25.16 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>