More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65748 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  100 
 
 
515 aa  1053    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  79.84 
 
 
530 aa  830    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05549  MFS phospholipid transporter (Git1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07750)  53.2 
 
 
488 aa  488  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  43.51 
 
 
519 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  35.56 
 
 
508 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00040  metabolite transporter, putative  32.33 
 
 
502 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160358  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02864  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 
473 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.07 
 
 
459 aa  146  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  26.97 
 
 
442 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  26.73 
 
 
442 aa  131  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  26.75 
 
 
443 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  26.77 
 
 
441 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.35 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.68 
 
 
469 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  25.7 
 
 
729 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  23.59 
 
 
663 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.69 
 
 
471 aa  94.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.97 
 
 
463 aa  90.5  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  23.66 
 
 
442 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25.73 
 
 
467 aa  87  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  23.41 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.04 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.65 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  22.2 
 
 
663 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.26 
 
 
452 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  24.48 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  23.41 
 
 
555 aa  75.1  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  23.81 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.32 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25.05 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01612  phosphate transporter (AFU_orthologue; AFUA_4G09210)  30.39 
 
 
664 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0276272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  24.36 
 
 
451 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  23.11 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  21.5 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  23.93 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.05 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.05 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.05 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.05 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  21.89 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.84 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.05 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.05 
 
 
443 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.14 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  24.65 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  22.14 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.3 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  25.16 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  22.82 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  24.88 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  22.44 
 
 
399 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
454 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.35 
 
 
485 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.35 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.35 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  22.33 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.35 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  23.64 
 
 
458 aa  64.7  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  22.35 
 
 
399 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  22.08 
 
 
399 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  22.08 
 
 
399 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  22.08 
 
 
399 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.78 
 
 
468 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  22.08 
 
 
399 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22.08 
 
 
399 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.89 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  26.22 
 
 
449 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.89 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  26.96 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
399 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  24.05 
 
 
464 aa  62  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
489 aa  61.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  28.07 
 
 
453 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
466 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.35 
 
 
487 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.35 
 
 
487 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.35 
 
 
487 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  24.1 
 
 
442 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  25.7 
 
 
444 aa  60.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  22.59 
 
 
499 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  24.29 
 
 
458 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
451 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  30.32 
 
 
452 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  30.15 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.33 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  24.04 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  24.11 
 
 
463 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.92 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  27.9 
 
 
481 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  29.71 
 
 
504 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  32.68 
 
 
457 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.05 
 
 
412 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>