More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1265 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  100 
 
 
451 aa  887    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  60.18 
 
 
452 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  35.45 
 
 
456 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  36.52 
 
 
458 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  35.19 
 
 
460 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  31.93 
 
 
442 aa  204  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.87 
 
 
459 aa  182  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.28 
 
 
471 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  30.87 
 
 
443 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  31.17 
 
 
442 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  28.88 
 
 
469 aa  170  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  30.87 
 
 
441 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  30.95 
 
 
442 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  29.3 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  29.89 
 
 
465 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  28.57 
 
 
458 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
477 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.19 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.62 
 
 
463 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
423 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.19 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.16 
 
 
464 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  23.35 
 
 
471 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.86 
 
 
447 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  25.39 
 
 
555 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.74 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 
468 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
465 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
465 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  25.45 
 
 
382 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.39 
 
 
445 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  25.55 
 
 
381 aa  107  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  28.83 
 
 
403 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
451 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  25.16 
 
 
457 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  26.72 
 
 
477 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.96 
 
 
452 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.76 
 
 
438 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.54 
 
 
453 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.11 
 
 
435 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
435 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  23.39 
 
 
415 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  24.31 
 
 
441 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.39 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.2 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
398 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.32 
 
 
432 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
472 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.77 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.77 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.77 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.77 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  24.77 
 
 
399 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  23.82 
 
 
480 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  25.21 
 
 
475 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  23.71 
 
 
432 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.11 
 
 
399 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  27.49 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  24.78 
 
 
474 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
399 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.12 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  26.1 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.27 
 
 
472 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
473 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.31 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  23.49 
 
 
432 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  23.49 
 
 
432 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  24.65 
 
 
555 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  27.06 
 
 
519 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.05 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  23.97 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.12 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  23.97 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
460 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  23.7 
 
 
458 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  23.7 
 
 
458 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.71 
 
 
427 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  24.84 
 
 
432 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.72 
 
 
399 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  24.45 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25 
 
 
476 aa  96.7  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  24.57 
 
 
438 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.06 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  23.85 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  23.97 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.94 
 
 
480 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  22.77 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  24.94 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  25.11 
 
 
497 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.32 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  23.48 
 
 
428 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.62 
 
 
432 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>