More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1514 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  100 
 
 		 474 aa  929    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  65.53 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  63.83 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  63.23 
 
 		 466 aa  594  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  61.83 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  61.51 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  53.63 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  48.83 
 
 		 486 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  47.68 
 
 		 544 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  49.57 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  49.58 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  49.68 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  47.66 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  50.87 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  48.02 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  48.08 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  51.32 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  50.44 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  50.33 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  47.47 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  50.44 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  50.44 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  48.81 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  46.38 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  48.48 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  46.54 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  46.48 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  50 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  47.12 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  47.25 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  45.91 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  48.57 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  39.51 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  39.11 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.51 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.98 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  38.7 
 
 		 442 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  35.73 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  35.05 
 
 		 477 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.38 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  37.04 
 
 		 457 aa  282  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  39.18 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  38.34 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  35.61 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.69 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.41 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.25 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  34.58 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.84 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.36 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  35.4 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.91 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.91 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.15 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.86 
 
 		 475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.09 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.29 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.82 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.19 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.89 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.27 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  34.11 
 
 		 497 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.61 
 
 		 474 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  38.53 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.22 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.83 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.08 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.45 
 
 		 444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.67 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.91 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  34.85 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  31.69 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.92 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  33.04 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  30.44 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  32.12 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  30.17 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.12 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  33.19 
 
 		 477 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  32.33 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  33.04 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  32.16 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  30.67 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  37.61 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  30.23 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.95 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.95 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  32.61 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  32.61 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  32.61 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>