More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0118 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  100 
 
 		 480 aa  950    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  62.78 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  59.47 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  55.03 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  51.85 
 
 		 468 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  45.93 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  46.52 
 
 		 477 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  43.56 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  44.02 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  43.97 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  46.34 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  43.25 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  45.13 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  43.64 
 
 		 473 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  41.4 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.75 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.11 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  37.11 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.68 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  36.55 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  37.17 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  36.33 
 
 		 474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  37.79 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.08 
 
 		 459 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  38.53 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  36.85 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.41 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.02 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.91 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  36.84 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  33.85 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.69 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.08 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.2 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  35.62 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  33.12 
 
 		 471 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.6 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.83 
 
 		 465 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  33.12 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  33.12 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  35.06 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  36.76 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  32.52 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  32.09 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.11 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  34.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.82 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  34.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.11 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.11 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.11 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  33.26 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.11 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.11 
 
 		 472 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.26 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  34.89 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  37.07 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.92 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.92 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.71 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.92 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.92 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.92 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  36.44 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  36.44 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  33.78 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.37 
 
 		 471 aa  239  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  33.56 
 
 		 473 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  33.26 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.63 
 
 		 533 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  36.76 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.71 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.68 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  34.59 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34.85 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  30.5 
 
 		 529 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  32.96 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  31.42 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.53 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.15 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  33.68 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  31.14 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  33.4 
 
 		 509 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.95 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30.11 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.97 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  31.77 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>