More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0368 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  100 
 
 
448 aa  879    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  54.91 
 
 
464 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  51.81 
 
 
457 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  52.01 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  50.11 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  50.45 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  50.8 
 
 
430 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  48.78 
 
 
444 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  44.59 
 
 
445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  45.59 
 
 
443 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  46.28 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  37.61 
 
 
491 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  37.18 
 
 
491 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  37.18 
 
 
491 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  37.18 
 
 
491 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  37.18 
 
 
491 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  37.18 
 
 
491 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  37.5 
 
 
448 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  37.18 
 
 
491 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.59 
 
 
491 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.78 
 
 
477 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  34.51 
 
 
475 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  38.31 
 
 
468 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  34.73 
 
 
478 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.41 
 
 
474 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.77 
 
 
450 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  35.28 
 
 
466 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  34.51 
 
 
485 aa  262  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  36.52 
 
 
467 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  34.33 
 
 
485 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  36.99 
 
 
442 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  32.9 
 
 
486 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  33.26 
 
 
479 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  32.95 
 
 
524 aa  252  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  32.25 
 
 
499 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.14 
 
 
468 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.45 
 
 
492 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  36.54 
 
 
480 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.35 
 
 
457 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  34.62 
 
 
493 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.09 
 
 
468 aa  246  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.18 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  33.19 
 
 
487 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  35.35 
 
 
480 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  32.82 
 
 
479 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.48 
 
 
473 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  33.33 
 
 
475 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.48 
 
 
466 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.44 
 
 
482 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  32.81 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.02 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  33.19 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  32.07 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.54 
 
 
458 aa  232  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  31.59 
 
 
544 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  32.81 
 
 
518 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.74 
 
 
450 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  33.77 
 
 
482 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.09 
 
 
468 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34 
 
 
474 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.77 
 
 
477 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31.37 
 
 
497 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  34.23 
 
 
471 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.78 
 
 
472 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34 
 
 
472 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.78 
 
 
472 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.26 
 
 
497 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  34.29 
 
 
491 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  31.43 
 
 
469 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.78 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  33.85 
 
 
470 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  34.29 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  34.29 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  34.29 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  34.29 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  34.29 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  32.17 
 
 
486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34 
 
 
452 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34 
 
 
452 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.23 
 
 
463 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  33.26 
 
 
492 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  33.26 
 
 
492 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  33.26 
 
 
492 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.56 
 
 
507 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  33.03 
 
 
475 aa  222  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  32.18 
 
 
494 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.82 
 
 
533 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.28 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  32.77 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>