More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0853 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  100 
 
 		 459 aa  909    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  71.09 
 
 		 471 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  41.36 
 
 		 484 aa  317  4e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.22 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  38.69 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  38.01 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  37.74 
 
 		 472 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.5 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.76 
 
 		 482 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  37.98 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.59 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.36 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  38.08 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  37.99 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.77 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.85 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  37.36 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.24 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.07 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  37.39 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  35.04 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  36.28 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34.84 
 
 		 480 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.28 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  35.78 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38.05 
 
 		 468 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.34 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  32.67 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  38.22 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.6 
 
 		 533 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.65 
 
 		 475 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.86 
 
 		 466 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.19 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.15 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  31.85 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.03 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.4 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.09 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.86 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.08 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.33 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  35.54 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.55 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.55 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.05 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.48 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.05 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  32.59 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.26 
 
 		 476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.25 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.29 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  37.53 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.67 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.56 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  32.18 
 
 		 561 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  31.95 
 
 		 468 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  32.48 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  31.32 
 
 		 471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  32.17 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  32.17 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  32.75 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  30.91 
 
 		 491 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  30.91 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  30.91 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  30.91 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  30.91 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  30.91 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  33.11 
 
 		 470 aa  212  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  32.36 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  36.82 
 
 		 482 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.58 
 
 		 477 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  32.24 
 
 		 467 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  32.88 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  31.2 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  32.17 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  32.17 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  32.17 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  32.17 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  32.17 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  32.07 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  32.17 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  33.26 
 
 		 487 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.95 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  31.75 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  31.75 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  31.75 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.75 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>