More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  100 
 
 		 468 aa  918    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  55.94 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  53.54 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  51.5 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  51.85 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  48.64 
 
 		 472 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  48.47 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  51.9 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  45.51 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  42.58 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  45.2 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  42.98 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  46.04 
 
 		 490 aa  359  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  43.49 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  42.42 
 
 		 477 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  42.42 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  41.1 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  38.07 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  44.39 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  36.63 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  38.07 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.86 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  37.31 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  36.58 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.64 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  39.78 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  42.04 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  37.09 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  38.95 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  39.68 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  35.48 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.69 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  37.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  37.88 
 
 		 472 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  37.88 
 
 		 472 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  38.19 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  37.88 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  37.25 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  37.34 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  37.88 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  38.08 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  37.88 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  37.88 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  37.88 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  37.45 
 
 		 468 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  37.88 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.06 
 
 		 475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  37.66 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  38.1 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  38.1 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.53 
 
 		 533 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  38.1 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  38.1 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  38.1 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  36.36 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.04 
 
 		 467 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  36.84 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.01 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.95 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  36.76 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  38.88 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  36.62 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  36.62 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  38.88 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  36.62 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  36.62 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  36.62 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  36.84 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  36.84 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.1 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  36.55 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.95 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  36.87 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  36.55 
 
 		 471 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  36.55 
 
 		 471 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  36.48 
 
 		 491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.32 
 
 		 480 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  36.42 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  39.01 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  34.63 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34.84 
 
 		 474 aa  257  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.65 
 
 		 450 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  37.14 
 
 		 476 aa  256  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.14 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  34.99 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  36.11 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  33.33 
 
 		 468 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  33.7 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  36.5 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.41 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  34.05 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.5 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  32.17 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  37.5 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>