More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3338 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  100 
 
 
464 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  81 
 
 
468 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  93.98 
 
 
465 aa  874    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  100 
 
 
464 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  69.98 
 
 
476 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  100 
 
 
464 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  97.41 
 
 
464 aa  899    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  97.2 
 
 
464 aa  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  100 
 
 
464 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  97.41 
 
 
464 aa  900    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  100 
 
 
464 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  65.57 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  64.91 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  65.79 
 
 
471 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  65.57 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  65.57 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  64.91 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  65.57 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  65.13 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  65.13 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  64.91 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  64.91 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  64.69 
 
 
472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  64.91 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  64.91 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  65.35 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  58.43 
 
 
472 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  51.95 
 
 
480 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  41.61 
 
 
477 aa  322  7e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  40.22 
 
 
463 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  41.24 
 
 
480 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  39.78 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1362  sugar transporter  43.32 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  37.06 
 
 
458 aa  285  9e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  40.8 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.66 
 
 
492 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  37.08 
 
 
448 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  38.72 
 
 
446 aa  276  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.62 
 
 
468 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.34 
 
 
473 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.99 
 
 
473 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  37.81 
 
 
452 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  37.81 
 
 
452 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.9 
 
 
472 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  38.51 
 
 
480 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.74 
 
 
474 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  35.31 
 
 
475 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  36.51 
 
 
533 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.27 
 
 
447 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  36.26 
 
 
497 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.2 
 
 
466 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  34.68 
 
 
485 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.36 
 
 
516 aa  257  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.71 
 
 
507 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.87 
 
 
473 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.51 
 
 
450 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  39.41 
 
 
456 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.05 
 
 
482 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  36.23 
 
 
468 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  35.65 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.23 
 
 
480 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.34 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.99 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  34.21 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.91 
 
 
475 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  34.75 
 
 
477 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  33.48 
 
 
482 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.73 
 
 
450 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.96 
 
 
484 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  33.62 
 
 
459 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.43 
 
 
457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  34.14 
 
 
490 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  33.92 
 
 
480 aa  240  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.79 
 
 
442 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  32.54 
 
 
471 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  32.54 
 
 
471 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  32.32 
 
 
471 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  33.41 
 
 
491 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.51 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0826  sugar transporter  34.09 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.72 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.48 
 
 
441 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.97 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.29 
 
 
464 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  32.43 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  34.46 
 
 
482 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.43 
 
 
491 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.07 
 
 
480 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.43 
 
 
491 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.43 
 
 
491 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  34.99 
 
 
464 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.43 
 
 
491 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.43 
 
 
491 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.43 
 
 
491 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>