More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0869 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  100 
 
 
457 aa  916    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  66.45 
 
 
462 aa  624  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  38.77 
 
 
480 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  38.36 
 
 
482 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  37.11 
 
 
480 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  38.07 
 
 
468 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  37.53 
 
 
450 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  37.11 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  34.26 
 
 
490 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  35.45 
 
 
464 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.06 
 
 
477 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.38 
 
 
472 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.19 
 
 
473 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.87 
 
 
473 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  34.21 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  35.67 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.98 
 
 
533 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.5 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  30.63 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.85 
 
 
480 aa  209  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  30.52 
 
 
471 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34.03 
 
 
447 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30.33 
 
 
475 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  32.17 
 
 
485 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  29.76 
 
 
480 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  31.44 
 
 
446 aa  206  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  29.36 
 
 
477 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.8 
 
 
450 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29 
 
 
448 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.64 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.89 
 
 
448 aa  199  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  29.08 
 
 
465 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  28.88 
 
 
468 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.56 
 
 
459 aa  196  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  29.61 
 
 
468 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.32 
 
 
477 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  29.72 
 
 
464 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  30.53 
 
 
486 aa  194  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  30.97 
 
 
468 aa  193  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  29.72 
 
 
464 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  31.08 
 
 
474 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  29.72 
 
 
464 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  30.9 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  29.64 
 
 
491 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  28.64 
 
 
457 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  31.44 
 
 
443 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.02 
 
 
457 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.74 
 
 
466 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  30.82 
 
 
482 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  26.36 
 
 
478 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  30.26 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  29.4 
 
 
499 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.61 
 
 
441 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  30.69 
 
 
458 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.25 
 
 
466 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  28.29 
 
 
480 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  29.61 
 
 
507 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  28.54 
 
 
487 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  28.64 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  27.23 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.37 
 
 
484 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  30 
 
 
492 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  30 
 
 
492 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  30 
 
 
492 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  30.55 
 
 
468 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  26.34 
 
 
480 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  29.19 
 
 
464 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  29.77 
 
 
490 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  29.45 
 
 
467 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  28.12 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  26.7 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  29.82 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  28.12 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  28.38 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  27.59 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  30.11 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  30.04 
 
 
493 aa  173  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  28.48 
 
 
486 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  28.5 
 
 
463 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  26.46 
 
 
479 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  30.05 
 
 
430 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  30 
 
 
482 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  29.25 
 
 
524 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  28.57 
 
 
485 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  28.66 
 
 
496 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  28.34 
 
 
497 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  27.66 
 
 
445 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  29.65 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  28.03 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>