More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1766 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  66.45 
 
 
457 aa  641    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  100 
 
 
462 aa  922    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  37.26 
 
 
482 aa  292  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  39.29 
 
 
480 aa  288  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  39.03 
 
 
468 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  39.67 
 
 
480 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  38.42 
 
 
450 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  38.53 
 
 
480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  35.32 
 
 
477 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  32.49 
 
 
490 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.67 
 
 
473 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.85 
 
 
473 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.78 
 
 
472 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  36.43 
 
 
464 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  37.44 
 
 
475 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.48 
 
 
497 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.33 
 
 
533 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.79 
 
 
448 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.48 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.86 
 
 
471 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.14 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  31.37 
 
 
466 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.16 
 
 
492 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.17 
 
 
477 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  29.61 
 
 
485 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  30.3 
 
 
442 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  30.3 
 
 
457 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  31.3 
 
 
480 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  31.11 
 
 
446 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  29.12 
 
 
452 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.02 
 
 
457 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.35 
 
 
468 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  30.91 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  28.87 
 
 
478 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  32.18 
 
 
458 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  27.51 
 
 
459 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.26 
 
 
476 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  29.05 
 
 
499 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.02 
 
 
477 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  28.76 
 
 
474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.15 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  27.86 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  29.57 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.98 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  29.3 
 
 
491 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  27.86 
 
 
464 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  27.47 
 
 
480 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  27.65 
 
 
464 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  30.54 
 
 
448 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  27.88 
 
 
507 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  28.27 
 
 
467 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.69 
 
 
484 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  29.14 
 
 
468 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  29.85 
 
 
486 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  31.3 
 
 
468 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.17 
 
 
441 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  27.29 
 
 
465 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  29.03 
 
 
468 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  30.12 
 
 
478 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  27.85 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  27.48 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  29.24 
 
 
474 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  30.08 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  26.82 
 
 
486 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  25.6 
 
 
480 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  29.85 
 
 
443 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  29.75 
 
 
468 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  26.79 
 
 
509 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  27.37 
 
 
544 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  29.82 
 
 
516 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.09 
 
 
444 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  25.63 
 
 
491 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  25.11 
 
 
491 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  29.11 
 
 
430 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  24.88 
 
 
482 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  27.83 
 
 
464 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  25.11 
 
 
491 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  29.79 
 
 
445 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  25.11 
 
 
491 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  25.11 
 
 
491 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  25.11 
 
 
491 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  25.11 
 
 
491 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.9 
 
 
584 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  30.47 
 
 
449 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  25.11 
 
 
491 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  28.8 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  28.43 
 
 
463 aa  156  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  28.37 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  29.05 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>