More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0105 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  100 
 
 		 482 aa  942    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  62.76 
 
 		 491 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  49.34 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  48.16 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  43.33 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  43.14 
 
 		 482 aa  349  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  45.68 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  41.1 
 
 		 471 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  41.1 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  41.1 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  41.83 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  40.73 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  42.69 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  39.78 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  39.78 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  38.85 
 
 		 474 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  37.55 
 
 		 472 aa  292  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  38.17 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  38.17 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  37.75 
 
 		 480 aa  287  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  40.76 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.58 
 
 		 447 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  36.34 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  36.92 
 
 		 473 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  38.08 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  36.92 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  37.69 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.54 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.95 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.84 
 
 		 480 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35.99 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  37.92 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.07 
 
 		 476 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  38.27 
 
 		 452 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  38.27 
 
 		 452 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.01 
 
 		 480 aa  256  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  35.68 
 
 		 477 aa  256  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.12 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.35 
 
 		 466 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.94 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  32.91 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  36.79 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  32.91 
 
 		 472 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  32.91 
 
 		 472 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  32.91 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  32.91 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  32.91 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  32.91 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  35.87 
 
 		 490 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  32.31 
 
 		 471 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  33.93 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.41 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  32.69 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  33.04 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  33.04 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  33.04 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  33.04 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  33.04 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.09 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.55 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.48 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  37.22 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  32.61 
 
 		 484 aa  243  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.48 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  36.77 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.2 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.98 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  33.4 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.98 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32.36 
 
 		 441 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.26 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.95 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.55 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.18 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  33.93 
 
 		 438 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.99 
 
 		 459 aa  226  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  32.28 
 
 		 471 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.6 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.63 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.74 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  31 
 
 		 457 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.18 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  31.6 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.91 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.91 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.91 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>