More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4212 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  100 
 
 		 477 aa  935    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  49.11 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  49.13 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  49.21 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  46.24 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  46.52 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  42.45 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  43.49 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  42.6 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  43.48 
 
 		 497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  42.52 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  41.56 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  43.43 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  39.69 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  39.69 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  37.73 
 
 		 477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.27 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.95 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.24 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  36.06 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  36.24 
 
 		 476 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.26 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  38.78 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  36.13 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35.63 
 
 		 468 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  35.8 
 
 		 471 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  36.88 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  35.1 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.79 
 
 		 533 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  37.08 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  35.6 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  35.6 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.4 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  36.23 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  35.68 
 
 		 482 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  34.15 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  31.18 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  33.26 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  36.2 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  36.3 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  36.5 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  36.04 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.22 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  36.09 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  36.09 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  36.29 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  36.29 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  36.29 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  36.29 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  36.09 
 
 		 472 aa  236  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  36.9 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  32.81 
 
 		 466 aa  236  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  36.09 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  36.09 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  36.09 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  36.09 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.87 
 
 		 472 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  33.26 
 
 		 467 aa  233  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.56 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.47 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.52 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  35.24 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.14 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.74 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.75 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.75 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.75 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  35.17 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.75 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.75 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.35 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  35.92 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.92 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  30.24 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.43 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.39 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  33.41 
 
 		 443 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.66 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.48 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.27 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.18 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.22 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  34.45 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  36.28 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  33.19 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  31.97 
 
 		 480 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.66 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.31 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.99 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  32.24 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.35 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  33.77 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>