More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3869 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  71.27 
 
 
486 aa  636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  75.47 
 
 
493 aa  671    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  100 
 
 
485 aa  946    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  62.84 
 
 
499 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  61.6 
 
 
486 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  63.58 
 
 
474 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  60.46 
 
 
544 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  59.13 
 
 
497 aa  521  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  59.58 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  58.56 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  58.63 
 
 
479 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  54.21 
 
 
504 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  57.39 
 
 
491 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  57.61 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  55.9 
 
 
469 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  53.81 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  49.45 
 
 
468 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  55 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  55 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  55.68 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  54.57 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  52.62 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  55 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  50.98 
 
 
480 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  51.49 
 
 
472 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  49.36 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  47.17 
 
 
466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  48.44 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  48.81 
 
 
474 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  50.54 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  48.37 
 
 
470 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  50.86 
 
 
479 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  37.1 
 
 
491 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  37.1 
 
 
491 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  37.1 
 
 
491 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36.71 
 
 
491 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  37.1 
 
 
491 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  37.1 
 
 
491 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  37.1 
 
 
491 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  37.77 
 
 
491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.5 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  38.16 
 
 
468 aa  296  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.76 
 
 
450 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.5 
 
 
485 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.89 
 
 
475 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.85 
 
 
467 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.51 
 
 
458 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.33 
 
 
448 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.33 
 
 
466 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  36.74 
 
 
442 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.33 
 
 
477 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.34 
 
 
438 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  37.04 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  35.64 
 
 
492 aa  263  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.5 
 
 
468 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.67 
 
 
457 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.04 
 
 
480 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.72 
 
 
484 aa  252  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.77 
 
 
457 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.55 
 
 
441 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.52 
 
 
464 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.33 
 
 
482 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  35.95 
 
 
468 aa  246  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.09 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.4 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.2 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  38.1 
 
 
516 aa  243  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.4 
 
 
476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.4 
 
 
497 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.57 
 
 
463 aa  236  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.57 
 
 
463 aa  236  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  35.38 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.35 
 
 
507 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  34.33 
 
 
443 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.16 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  35.6 
 
 
430 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.33 
 
 
468 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.32 
 
 
474 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.53 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.97 
 
 
480 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.2 
 
 
464 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.2 
 
 
464 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.2 
 
 
464 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.2 
 
 
464 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.2 
 
 
464 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  30.5 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.1 
 
 
480 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.57 
 
 
480 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.12 
 
 
464 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.12 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34.19 
 
 
452 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.15 
 
 
465 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34.19 
 
 
452 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.12 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>