More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3163 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  100 
 
 		 468 aa  917    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  66.15 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  61.51 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  59.79 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  58.72 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  56.42 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  49.01 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  51.75 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  49.67 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  51.33 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  49.79 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  48.08 
 
 		 544 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  50.22 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  49.36 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  49.34 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  49.01 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  49.68 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  48.35 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  48.89 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  48.17 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  48.89 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  49.89 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  48.89 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  48.15 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  47.66 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  45.32 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  46.9 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  43.47 
 
 		 480 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  46.35 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  45.28 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  46.64 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  48.06 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  38.38 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  37.65 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  37.45 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.18 
 
 		 491 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  38.51 
 
 		 450 aa  279  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  35.5 
 
 		 475 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  37.18 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.67 
 
 		 482 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  36.34 
 
 		 480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.88 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  36.19 
 
 		 442 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  34.57 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.48 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.64 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.37 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  35.64 
 
 		 477 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.19 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.29 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.36 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  35.78 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.78 
 
 		 450 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.19 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.5 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.64 
 
 		 492 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.08 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.45 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.38 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.75 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.74 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  37 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.82 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.24 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  34.67 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.69 
 
 		 475 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.93 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  34.53 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.5 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.19 
 
 		 463 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.19 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  34.66 
 
 		 477 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  32.33 
 
 		 497 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.48 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.69 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.35 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  34.05 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  33.98 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  30.04 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  35.56 
 
 		 430 aa  220  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34.6 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  31.81 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34.6 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  32.83 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.71 
 
 		 473 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.79 
 
 		 476 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.45 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.95 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  30.48 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.13 
 
 		 452 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  30.57 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.48 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2649  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 2  31.97 
 
 		 536 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123588  normal  0.0278702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.2 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.2 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>