More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2900 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  100 
 
 
475 aa  947    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  43.95 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  44.35 
 
 
466 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  41.97 
 
 
480 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  39.09 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.46 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36.88 
 
 
491 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  36.88 
 
 
491 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  36.88 
 
 
491 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  36.88 
 
 
491 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  36.88 
 
 
491 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  36.88 
 
 
491 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  36.88 
 
 
491 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.64 
 
 
450 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  40.52 
 
 
468 aa  296  6e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  36.24 
 
 
457 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  37.5 
 
 
468 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.97 
 
 
485 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.25 
 
 
491 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.67 
 
 
442 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  39.11 
 
 
437 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.06 
 
 
468 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.55 
 
 
477 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  37.28 
 
 
486 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  36.99 
 
 
467 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  35.68 
 
 
478 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35 
 
 
468 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  34.63 
 
 
475 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  35.58 
 
 
464 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.58 
 
 
464 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.58 
 
 
464 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.58 
 
 
464 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.58 
 
 
464 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.93 
 
 
441 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  36.16 
 
 
468 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  35.1 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  34.88 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.07 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.88 
 
 
464 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.33 
 
 
438 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  37.19 
 
 
463 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.28 
 
 
464 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  35.73 
 
 
480 aa  269  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  34.88 
 
 
497 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  36 
 
 
484 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.85 
 
 
476 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  36.73 
 
 
463 aa  266  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.41 
 
 
482 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  36.67 
 
 
493 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.66 
 
 
480 aa  263  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  35.49 
 
 
457 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.94 
 
 
450 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.7 
 
 
497 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.72 
 
 
447 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.75 
 
 
474 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  36.3 
 
 
544 aa  259  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  35.37 
 
 
499 aa  259  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34.86 
 
 
474 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.32 
 
 
444 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  31.92 
 
 
480 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.05 
 
 
466 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.65 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  34.9 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  34.9 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  34.9 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  34.42 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  34.9 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34.9 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.77 
 
 
533 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  34.9 
 
 
472 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  34.9 
 
 
472 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  34.9 
 
 
472 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  36.61 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  35.76 
 
 
446 aa  253  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  34.9 
 
 
472 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  34.66 
 
 
472 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  36.05 
 
 
486 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  34.66 
 
 
472 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  34.2 
 
 
485 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  34.66 
 
 
472 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  34.66 
 
 
472 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  34.66 
 
 
472 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  34.26 
 
 
480 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  33.82 
 
 
480 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.97 
 
 
472 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  36.73 
 
 
443 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  36.48 
 
 
494 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  34.51 
 
 
471 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.04 
 
 
471 aa  246  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  34.01 
 
 
443 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.81 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  36.03 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  36.03 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.05 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>