More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4403 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  100 
 
 		 492 aa  965    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  56.12 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  57.24 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  54.94 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  40.89 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  41.82 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  41.39 
 
 		 472 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  38.83 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  41.4 
 
 		 480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  41.69 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  45.33 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  42.21 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  41.8 
 
 		 463 aa  320  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  41.74 
 
 		 463 aa  319  7.999999999999999e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  41.1 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  39.78 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  37.36 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  39.48 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  38.34 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  37.73 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  38.63 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  38.27 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  39.24 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  38.88 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  39.69 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  41.07 
 
 		 452 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  41.07 
 
 		 452 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  38.15 
 
 		 452 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  37.58 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  36.66 
 
 		 484 aa  292  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.16 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  38.39 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  38.46 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  37.26 
 
 		 490 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.12 
 
 		 533 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  38.25 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  38.03 
 
 		 471 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  37.33 
 
 		 449 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.36 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  36.92 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  35.78 
 
 		 467 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  38.1 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  37.26 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  37.58 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  37.66 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  40.22 
 
 		 486 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  35.82 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  37.45 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.36 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  37.45 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  35.5 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  38.2 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.89 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  36.68 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  34.13 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  36.17 
 
 		 437 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  38.64 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  39.75 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.6 
 
 		 491 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.96 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  35.06 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  37.36 
 
 		 444 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  34.06 
 
 		 466 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.14 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.18 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.18 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.18 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.18 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.18 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  36.73 
 
 		 509 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  34.18 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.59 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  36.62 
 
 		 480 aa  253  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.89 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  36.71 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  36.57 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  37.5 
 
 		 493 aa  252  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  36.63 
 
 		 473 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  37.05 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  34.66 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  35.64 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  34.78 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  36.21 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  34.78 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  34.78 
 
 		 472 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.45 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  34.87 
 
 		 480 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  35.02 
 
 		 471 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>