More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0488 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  944    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  98.31 
 
 
473 aa  928    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  41.06 
 
 
463 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  40.62 
 
 
463 aa  315  8e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  40.64 
 
 
447 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  41.76 
 
 
456 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.21 
 
 
480 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38 
 
 
477 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  37.69 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  39.27 
 
 
452 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  39.27 
 
 
452 aa  281  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  37.12 
 
 
472 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  37.12 
 
 
472 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  37.12 
 
 
472 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  37.12 
 
 
472 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  37.12 
 
 
472 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  37.12 
 
 
472 aa  276  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  36.4 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  36.4 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  36.9 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  37.34 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  37.34 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  37.34 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  37.34 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  37.12 
 
 
472 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  37.96 
 
 
471 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  36.63 
 
 
492 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.34 
 
 
474 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.34 
 
 
448 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.01 
 
 
450 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.44 
 
 
468 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  35.67 
 
 
442 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  36.89 
 
 
452 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.41 
 
 
458 aa  259  8e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.27 
 
 
476 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.68 
 
 
480 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.83 
 
 
533 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  35.02 
 
 
472 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.83 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.43 
 
 
464 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.22 
 
 
465 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  35.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.08 
 
 
464 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  32.61 
 
 
467 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  35.43 
 
 
464 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  35.43 
 
 
464 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.67 
 
 
482 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  35.63 
 
 
491 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  33.78 
 
 
480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  32.13 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0826  sugar transporter  36.04 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.11 
 
 
457 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  31.28 
 
 
491 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  31.28 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  32.44 
 
 
468 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  36.34 
 
 
482 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  32.37 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.78 
 
 
466 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.03 
 
 
480 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.58 
 
 
457 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.44 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  38.6 
 
 
516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31.36 
 
 
450 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.42 
 
 
484 aa  233  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  34.29 
 
 
471 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.22 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  34.53 
 
 
464 aa  232  8.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.66 
 
 
480 aa  231  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.29 
 
 
485 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  31.15 
 
 
466 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  34.47 
 
 
475 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.1 
 
 
444 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  31.74 
 
 
441 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  28.91 
 
 
477 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  32.02 
 
 
477 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  34.51 
 
 
471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  32.61 
 
 
486 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  31.92 
 
 
507 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  34.57 
 
 
449 aa  222  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  30.72 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31.69 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  31.19 
 
 
480 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  32.17 
 
 
480 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  30.72 
 
 
470 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.55 
 
 
437 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>