More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1728 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  100 
 
 		 468 aa  930    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  66.95 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  63.83 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  65.58 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  61.57 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  55.04 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  56.42 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  52.15 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  52.33 
 
 		 474 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  49.78 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  49.67 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  49.45 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  48.83 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  47.08 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  50.67 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  50.22 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  47.74 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  48.66 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  50.67 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  50.67 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  50.67 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  51.33 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  47.4 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  46.95 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  50.66 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  45.34 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  48.86 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  46.74 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  45.4 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  47.46 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  46.75 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  45.98 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  38.45 
 
 		 491 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  38.45 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  38.45 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  38.45 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  38.45 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  38.45 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  38.45 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  37.09 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  35.61 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  37.72 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.8 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  39.54 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.33 
 
 		 477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  36.52 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  37.58 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  35.31 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.91 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.39 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.15 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.73 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.32 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  36.12 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  33.83 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.27 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.77 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.93 
 
 		 477 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  35.13 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.13 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  35.92 
 
 		 475 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.9 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.88 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.37 
 
 		 480 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  33.33 
 
 		 468 aa  250  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  35.09 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.74 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  34.05 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.91 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.7 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.99 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.67 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  32.77 
 
 		 474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.41 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  32.17 
 
 		 471 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  31.05 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.08 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  35.91 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.23 
 
 		 516 aa  236  7e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  30 
 
 		 529 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  32.68 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  32.75 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  30.66 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.42 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.3 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  33.48 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.9 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.9 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.26 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  30.43 
 
 		 524 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  31.03 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  31.26 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.85 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  30.98 
 
 		 473 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  34.19 
 
 		 493 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>