More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2102 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  100 
 
 		 457 aa  921    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  39.78 
 
 		 448 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  41.08 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  40.91 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  40.31 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  39.04 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  38.83 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.99 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  36.81 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.48 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  36.75 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  36.6 
 
 		 480 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  35.48 
 
 		 477 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  37.76 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  37.53 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  37.12 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.34 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  37.22 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  37.04 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  37.41 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  37.39 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  34.7 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.76 
 
 		 468 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.74 
 
 		 492 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  37.96 
 
 		 544 aa  266  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.04 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.2 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.28 
 
 		 477 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.5 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.99 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  36.23 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.89 
 
 		 480 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  34.6 
 
 		 437 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  37.36 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  35.86 
 
 		 497 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  35.35 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  35.73 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  35.19 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  34.62 
 
 		 504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  36.56 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.48 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  36.29 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  36.32 
 
 		 468 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.41 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.67 
 
 		 480 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  35.7 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  34.88 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  35.48 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.71 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.52 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.24 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  34.19 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.4 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  35.15 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.96 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.55 
 
 		 471 aa  240  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  35.51 
 
 		 474 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  34.17 
 
 		 486 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  34.68 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  32.59 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.97 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  34.86 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.11 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.15 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  34.55 
 
 		 472 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  35.87 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  33.41 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  36.29 
 
 		 475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34.32 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  34.62 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  34.62 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.15 
 
 		 507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  36.08 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  36.08 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  36.08 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  36.08 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  36.08 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  34.32 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  34.32 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  34.32 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  34.32 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  34.32 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  35.65 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  36.08 
 
 		 465 aa  232  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.65 
 
 		 464 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.93 
 
 		 463 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  35.23 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  34.1 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>