More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0959 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  100 
 
 		 472 aa  938    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  66.82 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  67.87 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  49.66 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  47.95 
 
 		 482 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  48.64 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  46.31 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  44.02 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  42.95 
 
 		 473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  42.73 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  42.58 
 
 		 490 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  42.6 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  42.73 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  40.66 
 
 		 480 aa  341  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  42.99 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  41.39 
 
 		 492 aa  332  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  37.77 
 
 		 464 aa  322  9.000000000000001e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  41.67 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  39.28 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  35.98 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  38.13 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  37.55 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.74 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.26 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.1 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  36.85 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  36.65 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  33.56 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  36.5 
 
 		 491 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  38.36 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  38.36 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.99 
 
 		 457 aa  263  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  34.18 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  36.11 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.9 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.9 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  35.9 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.9 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.9 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.48 
 
 		 533 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.81 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  36.3 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.48 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  35.59 
 
 		 463 aa  256  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.9 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.76 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  35.07 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35.76 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.55 
 
 		 472 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  36.6 
 
 		 484 aa  252  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  35.38 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.21 
 
 		 480 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  35.16 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.33 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.52 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.55 
 
 		 472 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.55 
 
 		 472 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.55 
 
 		 472 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.55 
 
 		 472 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  35.67 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  33.85 
 
 		 450 aa  250  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.27 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  37.47 
 
 		 472 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  34.45 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.85 
 
 		 507 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  35.29 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  32.82 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  34.48 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.57 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.37 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  35.35 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.85 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  35.81 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  35.19 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  35.19 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  35.19 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.23 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.65 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.65 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.65 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.65 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.65 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  35 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  36.57 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  34.78 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  36.7 
 
 		 493 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>