More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3294 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  91.95 
 
 
472 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  91.95 
 
 
472 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  91.95 
 
 
472 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  90.68 
 
 
472 aa  884    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  100 
 
 
471 aa  952    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  90.47 
 
 
472 aa  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  90.68 
 
 
472 aa  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  90.47 
 
 
472 aa  881    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  90.47 
 
 
472 aa  882    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  90.47 
 
 
472 aa  881    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  90.68 
 
 
472 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  90.47 
 
 
472 aa  883    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  91.95 
 
 
472 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  91.74 
 
 
472 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  90.79 
 
 
472 aa  881    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  65.19 
 
 
468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  65.79 
 
 
464 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  64.66 
 
 
464 aa  591  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  65.79 
 
 
464 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  64.87 
 
 
464 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  65.79 
 
 
464 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  65.79 
 
 
464 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  65.09 
 
 
464 aa  594  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  65.79 
 
 
464 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  64.52 
 
 
465 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  58.68 
 
 
476 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  51.02 
 
 
472 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  47.99 
 
 
480 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  38.84 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  38.84 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.49 
 
 
477 aa  294  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  38.3 
 
 
480 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1362  sugar transporter  39.18 
 
 
467 aa  266  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.26 
 
 
448 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  38.18 
 
 
473 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.42 
 
 
468 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.34 
 
 
447 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  37.96 
 
 
473 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.84 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.84 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.49 
 
 
480 aa  251  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.27 
 
 
472 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.19 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.98 
 
 
492 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.63 
 
 
507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.86 
 
 
458 aa  242  7.999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.84 
 
 
473 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.41 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  34.38 
 
 
475 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  33.84 
 
 
467 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  36.24 
 
 
474 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  32.31 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  33.94 
 
 
450 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  35.37 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  34.1 
 
 
480 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.13 
 
 
484 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  32.37 
 
 
471 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  32.37 
 
 
471 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.51 
 
 
475 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  32.67 
 
 
466 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.23 
 
 
448 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  32.15 
 
 
471 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  31.74 
 
 
491 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.33 
 
 
482 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  35.43 
 
 
477 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.41 
 
 
457 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.66 
 
 
444 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.99 
 
 
485 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  31.97 
 
 
457 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.04 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  33.04 
 
 
452 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.09 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.09 
 
 
516 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  36.2 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.55 
 
 
441 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  34.15 
 
 
437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  32.54 
 
 
544 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  32.09 
 
 
490 aa  220  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.19 
 
 
497 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  29.34 
 
 
491 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.79 
 
 
478 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.4 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.86 
 
 
450 aa  216  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.03 
 
 
449 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  31.44 
 
 
509 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  34.32 
 
 
443 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.62 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  30.84 
 
 
655 aa  215  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  30.19 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  30.19 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  30.19 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  30.19 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  30.19 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>