More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7518 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  100 
 
 		 507 aa  986    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.22 
 
 		 480 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.27 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.99 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  37.22 
 
 		 458 aa  293  7e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  38.95 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  36.46 
 
 		 533 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  36.49 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.98 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.85 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.08 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.21 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35.31 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.93 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.58 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.6 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.82 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  35.96 
 
 		 472 aa  259  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.37 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  35.54 
 
 		 442 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  35.68 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.07 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.29 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  34.19 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  33.83 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.97 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.97 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  33.97 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.97 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.97 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.97 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.97 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  33.55 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  33.55 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  34.13 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  33.55 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  33.55 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  38.88 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.91 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  33.76 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  33.55 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.12 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.34 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  33.19 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.19 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  35.43 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  37.41 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  36.79 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.71 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  32.55 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.71 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.81 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.84 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  35.44 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.32 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.62 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  35.11 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.78 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  36.84 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  34.62 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  34.74 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.26 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  31.74 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  33.64 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  31.62 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.38 
 
 		 473 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.68 
 
 		 475 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.83 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  35.7 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  31.45 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.48 
 
 		 448 aa  224  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  34.8 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  32.7 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  31.42 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  30.39 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  33.26 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  33.05 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  33.05 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  33.05 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  34.02 
 
 		 497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  34.03 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.1 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  35.32 
 
 		 482 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>