More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1681 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  100 
 
 
464 aa  933    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  46.77 
 
 
482 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  48.24 
 
 
480 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  46.04 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  43.43 
 
 
450 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  43.97 
 
 
480 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  42.98 
 
 
468 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  40.39 
 
 
490 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  37.77 
 
 
472 aa  335  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  39.47 
 
 
497 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  38.48 
 
 
473 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  39.69 
 
 
477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  37.69 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  39.91 
 
 
475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.58 
 
 
492 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  37.26 
 
 
477 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.53 
 
 
480 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  38.6 
 
 
446 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.53 
 
 
468 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  34.56 
 
 
457 aa  273  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  34.27 
 
 
462 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  35.62 
 
 
459 aa  256  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.84 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  33.41 
 
 
448 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.01 
 
 
474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.5 
 
 
476 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.13 
 
 
465 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  31.86 
 
 
466 aa  249  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34 
 
 
471 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.05 
 
 
466 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.51 
 
 
447 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  34.75 
 
 
473 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.9 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.46 
 
 
458 aa  244  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  35.81 
 
 
463 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.26 
 
 
507 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.81 
 
 
463 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  34.53 
 
 
473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  33.4 
 
 
482 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.99 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.99 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.99 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.19 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.99 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.99 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.19 
 
 
464 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.26 
 
 
449 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.19 
 
 
484 aa  237  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  32.89 
 
 
450 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  32.68 
 
 
485 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  31.79 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  33.48 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  32.1 
 
 
475 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.15 
 
 
491 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  33.56 
 
 
471 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  31.94 
 
 
491 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  31.9 
 
 
457 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  32.27 
 
 
491 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  33.33 
 
 
472 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.75 
 
 
480 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.11 
 
 
472 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.11 
 
 
472 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  33.11 
 
 
472 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.11 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.11 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.11 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.11 
 
 
472 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  33.78 
 
 
472 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.05 
 
 
468 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  30.27 
 
 
491 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  33.78 
 
 
472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.11 
 
 
472 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34.55 
 
 
452 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34.55 
 
 
452 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.9 
 
 
475 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.61 
 
 
533 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  32.68 
 
 
477 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.07 
 
 
457 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  31.86 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  36.73 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  32.41 
 
 
486 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  31.32 
 
 
452 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  31.48 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  30.95 
 
 
467 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32.13 
 
 
441 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>